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微生物菌种是宝贵的国家生物资源，对国民经济建设具有非常重要的价值 。农业部历来十分重视此项工作，早在1952年农业部设立兽医生物药品监察所(现名中国兽医药品监察所)时即责令该所负责收集兽医微生物菌种，进行鉴定和保藏，并为兽医生物药品制造单位、科研机构及农业院校提供应用，满足生产、科研和教学的需要。
为了更好地保护和利用我国的微生物资源，推进生物科学和生物技术的发展，1979年，在国家科学技术委员会的组织领导下成立了中国微生物菌种保藏管理委员会，下辖7个专业性保藏管理中心，兽医微生物菌种保藏管理中心是其中之一。根据国家科委的要求，农业部于1980年建立了兽医微生物菌种保藏管理中心，设在中国兽医药品监察所，专门从事兽医微生物菌种（包括细菌、病毒、原虫和细胞系）的收集、保藏、管理、交流和供应。同时，在中国农科院哈尔滨、兰州兽医研究所和上海家畜寄生虫病研究所建立中心的分管单位，负责专门菌种的保藏、管理。本中心是国家的菌种保藏机构之一，同时也是中国兽医药品监察所菌种保藏室。作为世界菌种保藏联合会数据库的成员，中国兽医微生物菌种保藏管理中心与世界大多数的菌种保藏机构建立了广泛的联系。
经过几代人几十年的不懈努力，国家兽医微生物菌（毒）种保藏中心已拥有雄厚的技术力量和先进的微生物鉴定与保藏手段及设备，是我国保藏微生物种类最多的保藏中心之一。中心的宗旨是广泛地收集国内外的兽医微生物资源，妥善保存，确保安全，为养殖业生产、环境保护、科研教育提供标准化的实验材料。
国家兽医微生物菌（毒）种保藏中心的工作主要包括：
1收集、保藏、鉴定、供应和交换各类兽医微生物菌毒虫种和传代细胞系；
2微生物菌种保藏技术和鉴定方法的研究；
3编辑兽医微生物菌种目录。
目前，国家兽医微生物菌（毒）种保藏中心主要采用超低温冻结和真空冷冻干燥保藏法，长期保藏细菌、病毒、虫种、细胞系等各类微生物菌种。到目前为止，收集保藏的菌种达230余种(群)、3000余株。20多年来，国家兽医微生物菌（毒）种保藏中心为我国科研院所、高等院校及兽医生物制品的生产企业，提供了6万多株各类兽医微生物菌种，为国民经济建设、工农业生产、环境保护和科研教育发挥了重要的作用，产生了巨大的社会效益和经济效益。我们将继续努力，更广泛地收集新的菌株，扩大保藏菌种的种类和数量，作好鉴定、保藏、管理和供应工作，建立一个更加充实的兽医微生物资源库，最大限度地满足科研、教学、生产社会发展的需要。
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